O território indiano se encontra dentro da biorregião himalaia, que apresenta grandes amostras de biodiversidade. Como é um dos dezoito países megadiversos, acolhe 7,6% de todos os mamíferos, 12,6% de todas as aves, 6,2% de todas os répteis, 4,4% de todos os anfíbios, 11,7% de todos os peixes e 6% de todas as espermatófitas do mundo.[45] Em muitas regiões indianas existem altos níveis de endemismo; em geral, 33% das espécies indianas são endêmicas.[46][47]
Os bosques da Índia variam de florestas úmidas nas ilhas de Andamão, Gates Ocidentais e noroeste indiano, até bosques frios do Himalaia. Entre esses extremos encontram-se os bosques caducifólios da Índia Oriental; o bosque caducifólio no centro-sul e o bosque xerófito do Decã central e a planície ocidental do Ganges.[48] Estima-se que menos de 12% da massa da Índia Continental esteja coberta por densos bosques.[49] Entre as árvores mais importantes da Índia encontram-se o neem medicinal, usado amplamente em zonas rurais para a fitoterapia e elaboração de remédios caseiros.
Muitas espécies da Índia são descendentes de táxons originários de Gondwana, que se desmembrou da placa tectônica indiana. O movimento posterior da placa até o subcontinente indiano e a colisão com a massa de terra da Laurásia deu início a um intercâmbio massivo das espécies. Entretanto, o vulcanismo e as mudanças climáticas registrados há mais de vinte milhões de anos provocaram a perda de milhares de espécies endêmicas da Índia.[50] A partir de então, vários mamíferos ingressaram à Índia desde a Ásia por meio de dois passos zoogeográficos a ambos os lados dos emergentes do Himalaia.[48] Em consequência, apenas 12,6% dos mamíferos e 4,6% das aves são espécies endêmicas, em contraste com 45,8% dos répteis e 55,8% de anfíbios endêmicos.[45] Na Índia existem 172 espécies ameaçadas, ou 2,9%.[51] Entre elas encontram-se o leão-asiático, o tigre-de-bengala e o Gyps bengalensis, que está quase ameaçado de extinção após ingerir carne de gado tratada com diclofenaco.[52]
Nas últimas décadas, as invasões humanas criaram uma ameaça à vida silvestre da Índia, em resposta, o sistema de áreas protegidas e parques nacionais, estabelecido pela primeira vez em 1935, que foi ampliado consideravelmente. Em 1972, o governo indiano decretou a Lei de proteção da vida silvestre[53] e o Projeto Tigre, para proteger o habitat crucial deste animais, além de em 1980 ter sido decretada a lei de conservação dos bosques.[54] Junto com mais de quinhentas espécies da vida silvestre, na Índia treze reservas biosféricas,[55] quatro das quais fazem parte da rede mundial de reservas da biosfera. Cerca de vinte e cinco zonas de umidade estão registrados na Convenção sobre as Zonas Úmidas.[56]
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